太平天国重视医疗卫生，无谕朝内、军中、居民都有医疗卫生组织，而军中织织尤为特色。至於讲求卫生，扑灭毒害，广种牛痘，建立近代医机构等项，都是值得称道的。虽文献残缺，未能见其全部设施，而规模用意还约略可见。兹分述於下。
一医疗卫生组织
太平天国医疗卫生组织，在国家制度上，有一定的组织，已经形成为一种正规化的制度。它可分为朝内、军中、居民三个系统。
朝内医疗卫生组织，设殿前国医一人，「为典内医之首」〔一〕，也是国家卫生工作最高的负责人，故「属官至多」〔一〕。太平天国丙辰六年七月前，任国医的是素精医理参加金田起义的补天侯李俊昌。在国医之下，设天朝督内医四员，职同指挥。开朝掌医四员。专治外科，也职同指挥。又内医四员，职同将军。内医七员，职同总制。又内医七员，职同临军。朝内拯危急一员，职同将军。留朝内诊脉医生九员，职同军帅〔二〕.
军中医疗卫生组织，各军设内医四员，治内科，职同总制，又内医十四员，职同军帅恩赏检黠督医将军一员，掌医二十五员，治外科，职同总制。拯危急一员，职同监军，属官无数，皆治外科，主疗受伤的人员〔三〕。这个数目相当大，以恩赏检黠督医将军官职最高，当是各军的卫生工作领导人。其中可看出一个特黠，即外科人员的配备可算得是坚强的，除二十五人外，还有拯危急，并且「属官无数」。太平军每军实际人数为二千五百人，以二十五个外科医生计算，每百人中就有一个外科医生，这是一个很健全的医疗机构了。此外尚有理能人，就是护理病人员，其员数无定额，其主要工作是料理伤病员的茶饭汤药。又设功臣一员，主管军中药料〔一〕。
民间医疗卫生组织，天京各街道设医生六十员，职同军帅〔二〕。这六十个医生是专给天京人民治病的，每逢初一、十五都到督内医衙黠名〔三〕。这是一种例会，以便检查人数，指导工作等。这时候，天京行供给制，这一种医疗制度，就是一种公医制度。
在朝内官中设有医骡马一员，即马医，专医天京马疾〔四〕。军中有无专设马医，情况不详。
关於药品，在行营规矩第五条特别规定，不得「搜操药材铺户」,使战时药材商人照常营业，药品的供应，得以源源不绝。到建都天京后，在天京实行公有制度，城中大小药店。均归公有，在红纸郎大街设立总药库，由内医专管〔五〕。其药品用分配制度供应〔六〕，详细情况不详。
二保健卫生设施
太平天国对人民保健有几项设施是值得注意的。一、禁鸦片烟，天王在宣传革命时，就做有一首助式诗教导群众，诗道：
烟枪即炮枪，自打自受伤，
多少英雄汉，弹死在高床〔一〕。
到太平天国癸好三年四月，天王在天京又特下式吸鸦片诏，诏道：
吹去吹来吹不饱，如何咁蠢变生妖！
戒烟病死甚诛死，脱鬼成人到底高〔二〕。
并在弄律上定：「凡吹洋烟者斩首不留」，用岩刑推行禁令。二、禁娼，太平天国在法令上宣布：「一夫一妇，理所宜然」，凡有宿娼当娼的斩首不留〔三〕。三、对婴儿的保护，在天京设有娃崽馆，设有育婴官（后改为育材官）专司其事，有类於现在的托儿所、幼儿园的组织〔一〕。四、解放缠足。五、设老人馆以养老。
中国是一个讲究卫生的国家。「黎明即起，，洒扫庭除」「街道十分宽大，环境清洁，为中国所罕见」〔一〕。在公共卫生上，太平天国又发动举群众捕鼠、灭臭虫〔二〕。
中国古代在医疗上有一种叫做祝由科，专用符咒治病。太平天国叫符咒做「妖符」，禁止行使〔三〕，把中国几千年来的迷信治疗办法革除了。在医疗上说，这是一件大功绩。
但对祖国医学宝贵遗产的针灸疗法却知道保存，有针灸专科医师治病。有一个病人自述，他在戏场看戏，忽发痧症，倒在地上已过了一刻。适有一位针灸医师带有医具在戏场，急行救治。初刺二十多针，没有血，众人都以为不能救，要抬去埋葬。这位医师力阴，复力刺两腿曲处始见紫黑血，再刺唇际两针，始出声，把这个濒死的急症病人救活了〔四〕。
中国古代把医师看做巫觋一流人。太平天国却尊重医师。中央政府屡次诰谕招访良医，所有「大小方脉，内外专科，眼科，妇科，以及专理小儿急慢惊风等症」的医师，都一体招访。地方政府也把「医士之能内外科者」高列在招贤榜上。医师在太平天国政府的重视下，对於医学一定会得到促进。据记载，东王杨秀清於癸好三年七月患眼疾剧甚，由典内医李俊昌率领各医尽力诊治，到甲寅四年四月，得以医俞，李俊昌以这一件功劳封补天侯〔一〕。其医经疗经过，应该是值得研究的。只因记载残缺，杨秀清患的是何种岩重的眼疾，用何方剂，都没有记及，。至於其他各方面医药疗效，更难於稽考了。
三军中医疗卫生工作
太平天国军队的医疗卫生工作是值得注意的。打伏时，担负立刻救治的是拯危急（急救医生），规定：「凡有打仗伤者，则有拯危急一人，先以草药敷之」〔二〕。在军中和朝内都有拯危急医生以抢救伤员。其所用的草药，是经过成千成万次的监床经验得来的，只可惜没有记载可考了。
伤员在敷草药救治后，即送去能人馆疗养〔三〕。太平天国对伤员是极为关怀的，照顾周到。当金田起义初，辛开元年七月十九日，天王在桂平茶地下诏道：「据奏说多病伤，护持紧，兄弟姊妹不保齐，辱及天父天兄」。又道：「各军各营宜间匀连络，首尾相应，努力护持老幼男女病伤，总要个个保齐，同见小天堂威风」。后来颁布的行军总要在体惜号令裹就把具体办法规定出来说道：
凡为佐将者，当知爱惜兵士。譬如行营，沿途遇有被伤以及老幼人等，遇有越岭过河，不能行走者，必须谕令各官，毋谕何人，所有马匹俱牵与能人骑坐；如马匹不敷，总要令兵士抬负而行，庶无遗弃。至於扎定营盘之时，必须谕令拯危官员，将所有能人，每逢礼拜之期，务要查实伤俞者几名，伤未愈者几名，一一报明。令宰夫官三日两日按名给肉，以资调养。又令掌医、内医格外小心医治，择选新鲜药饵，不可因其脓血之腥臭，而生厌心。其为佐将者，当公事稍暇，亦必须亲到功臣衙看视。其有亲属者，看其远近，酌量令其前来照料，无亲属者，本营兄弟总要小心提理，念同魂父所生，视为骨肉一样。
在这一条行军法令中，可以看出许多有价值的地方：一、伤员不得遗弃，必须个个保齐，官员的马匹应给伤员骑，不够，由兵士抬走，以解决战时的伤员运输力；二、建立每星期的检查报告制度，从中也可以看出治疗效率；三、伤员的营养增加，两三天就给肉，这是一般人所没有的，只有在当时五级官阶的总制以上才有肉给；四、不谕医生、长官、土兵都应关心照顾伤员。这种规定，只有革命队伍的阶级友爱才能发挥这种精神。
关於统计病、伤、死亡等都规定有特殊的记号。行军总要查察号令规定：凡两司马及各典官，每晚都要将自己统下牌面人等，按照名册，逐一黠名一次，如身体有病的，即用朱笔在名牌人名上画一圆圈，受伤的用朱笔在名上画一三角圈，逃走的用朱笔在名上打一拷义，死亡的用朱笔在名上一黠，使一见名牌，便知人数。
至於军队中的卫生工作，是有法令规定的。在禁令中有：「凡营盘之内，俱要清洁打扫，不得任意运化作践，有污马路，以及在无羞耻处润泉」。「运化」，就是大便，「润泉」，就是小便，都是太平天国的隐语。在行营规矩第八条又规定：「不得焚烧民房及出恭在路并民房」。以焚烧民房与大便在路上和民房内相提并谕，可见太平天国军营卫生要求的严格。这样的军队，这样的条令，历史上是少有的〔一〕。
四推行新医术及设立近代医疗机构
种牛痘以免天花，是十八世纪末年发明的一种人工免疫的新医术。太平天国建都天京后，就大力推行这种新医术，指定地黠，出布告通知人民，前往种痘〔一〕。这是中国痘史上用政府的力量为人民普遍布种牛痘的创举。
已未九年，洪仁玕到天京，他在资政新篇中主张兴设医院以济疾苦，凡医师必须经过几场考试，然后任用。期经费，没收庙宇寺观的产业，以为兴建医院的应用。并由政府将励，鼓舞人民广设医院。洪仁玕的主张受了当时条件的限制，不曾得到普遍的施行，但是，由於他的提倡，天京已有作为近代医疗机构的新医院的建设。据英国人孛辣司等到天京访问，他们看见那一个做干王洪仁玕外交翻译的美国教士罗孝全居住的地方的后面，就设立有一所医院〔二〕。
