這本「閩海紀要」是根據連雅堂氏的「臺灣詩薈」本標點排印的。在「臺灣文化三百年紀念會」出版的「臺灣史料集成」裡，載有「臺南連雅堂氏藏」之「海紀輯要」的「寫真」。但是，一經比照，這一「寫真」的「海紀輯要」，與中央研究院歷史語言研究所的「海紀輯要」抄本大有出入，而與「臺灣詩薈」本的「閩海紀要」卻全相同。因此，很可懷疑，本書原名「海紀輯要」，「閩海紀要」四字系由連氏改題的。至於兩書內容之所以不同，或許一為初稿、一為改正稿；這有待於專門的考證了。茲錄「臺灣詩薈」本的連氏原序於下，以供參考；但其中並無「改題」之言。

『余居承天，延平郡王之東都也。緬懷忠義，冀鼓英風；憑弔山河，慨然隕淚。洎長讀書，旁及志乘；而記載延平，辭多誣衊，餘甚恨之。弱冠以來，發誓述作，遂成「臺灣通史」三十六卷；尊延平於本紀，稱曰「建國」。所以存正朔於滄溟、振天聲於大漢也。筆削之間，搜求故籍，其載延平者，則有黃宗羲氏之「賜姓始末」、鄭亦鄒氏之「鄭成功傳」、江日昇氏之「臺灣外記」、鷺門夢■氏之「海上見聞錄」，皆實錄也。今乃復得「閩海紀要」，讀之狂喜；以為漢族不湮，此書其必顯矣。書為泉南夏元斌先生撰，而陳鐵香太史所藏者。起隆武元年，訖永曆三十七年；凡鄭氏三世之事，編年系月，巨細靡遺；而尊崇延平，義如綱目，是正史也；且足補吾通史之缺。因繕副本，付之梓人。而延平之精忠大義、東都之締造經營、謀臣猛將耆舊名流之功勳文采，炳炳琅琅，並傳天壤，豈非一大快事哉？東寧滅後二百四十有二年歲次甲子冬至日，臺南連橫序於大遯山房』。

因為本書原由連氏「傳繕印行」，所以錯字、脫字特多。茲經吳幅員兄參考「海紀輯要」及其他有關著作，悉心校勘。凡屬舛誤之處，則逕予改正；凡涉疑義之處，或於改正之後再用（）注明原文，或於原文之下用〔〕注明疑是或疑漏之文，亦有附？號以存疑者；其有衍文而予刪去者，亦經注明。如此，總計凡九十餘處之多，非易事也。

周憲文於臺北惜餘書室。