这场哗变发生在甘肃提督高连升的营里。事情的起因，须从刘松山入陕进攻董福祥说起。
初始，刘松山见董福祥拥军达十余万人，惧其势大，未敢贸然进攻，后经过详细打探，得知董军虽人众，但器械不精，兵卒手里多持长矛、大刀作战，洋枪极少，洋炮更无一尊。刘松山这才放下心来，开始率军逼近董军，并放洋枪扫射。
董福祥率队出迎，先遭遇官军一顿猛烈的火枪射击，阵脚不由大乱。这时，偏巧一发炮弹射来，将董福祥的中军大旗轰倒。董军于是疑其主帅已殁，便开始四散奔逃。董福祥阻饬不住，也被协裹起来奔跑，导致漫山遍野都是奔逃的回民义军。刘松山先是命令各营包围厮杀，后又亲自骑马率两营亲兵，冲入董军大营里面去作战。也是事有凑巧，该着刘松山立此大功。刘松山冲进董军大营不一刻，偏偏就和董福祥走了个满怀。董福祥当时身穿龙袍，头戴皇冠，极其显眼。
刘松山一见，料定必是董军主帅自称大皇帝的董福祥无疑，便策马近前，大喝一声：“董福祥！刘松山在此，你还不下马受降，还要等到什么时候！”
董福祥见刘松山到此，还道全军已然覆灭，加之官军火枪火炮极多，自忖不敌，便就势双膝跪倒在刘松山的马前，口称：“败军之将不言勇，福祥愿降也。”
刘松山一听这话，自是喜从天降，当即让身边的亲兵将董福祥身上的枪械拿下，随后令董福祥作速传命下去，让所部放下器械，听候官军发落。刘松山入陕第一战，便创造了天大的奇迹。
左宗棠接报大喜，当天即派人急赴刘松山大营，帮同料理善后事宜，又让刘松山转饬董福祥，从回民义军旧部挑选出三营兵勇，交由董福祥统带。
左宗棠素知董福祥作战勇猛，加之该人在这里土生土长，对这里一草一木及回军各营情况都熟，不想浪费了这个人。
左宗棠随后着令刘典、高连升两路人马，连夜向董志原、宁州一带进发，与刘松山、刘锦棠，从三个方向对进，围剿白彦虎。
就在高连升率军离开西安的第五日，所部九营发生闹饷哗变事件。
后据刘典派人向左宗棠报称：那日晚，高连升中军大帐设在杨店。约在子夜时分，亲兵营哨长丁玉龙，会同左营管军装差弁邬宏胜、左营哨长蒋宏高、前哨什长石文科等，突至大帐，声称与高军门计议饷事。哨兵声称军门已歇，欲加拦截，被邬宏胜挥刀斩杀，旋突入大帐，摸黑寻至高连升榻前。
高连升业已惊醒，喝问何事。邬宏胜答称：索还欠饷，欲另投他处。高连升大怒，反问一句：“伊欲反耶？”邬宏胜就一步跨前，挥刀乱剁，曰：“就是要反！”
邬等戕杀高连升后，将高连升首级割拿在手，出营呼曰：“军门欠饷，不顾我等死活，已斩杀矣！我等欲投他处，愿往者随之。”各营从者甚众，竟有八营之多；有不想反者，因怕性命不保，也只得随行。大营营官、总兵衔副将贺茂林、提督衔总兵黄毓馥二人，挺身劝阻，被众兵勇杀死。
刘典闻变之后，立派记名提督丁贤发亲率所部，进耀州，扼其南窜，然后亲提所部各营向杨店进发，准备用武力平叛。哗变各营见大军赶到，于是拼死抵抗，终因无人指挥，很快向后败退。
刘典一面追击，一面招抚，很快便有五营人马受抚，有四营在奔逃过程中被赶来的官军斩杀。兵变终被平息。
此次兵勇哗变，给左宗棠造成的损失颇大，不仅四个营的番号被取消，还折损了高连升、贺茂林、黄毓馥三员大将，这倒正应了那句古话：“屋漏偏逢连天雨，故知又是讨债人。”
西安粮台在高连升大营哗变的当夜，便收到曾国藩紧急筹助的十万两饷银，随后又有李鸿章的十万两到账；尤其是胡雪岩派人送到的有利银行借款合约到左宗棠之手后，左宗棠才算彻底地松了一口大气，知道西征的危机是真正地过去了。
白彦虎在各路官军抵达宁州之前，便已将所部分成四路人马，分由白彦虎、马正和、崔伟、于得彦四人统带，拟趁官军尚未合围前，退往金积堡一带与马化龙会合。
白彦虎的如意算盘被刘锦棠识破。刘锦棠亲赴老湘军大营相商于叔父刘松山，想提前发起对白彦虎的攻击。
刘松山却说道：“白贼不同于董福祥。白贼久居董志原一带地方，又几次从洋人手里购得洋枪洋炮，逆众骑、步各半，颇有战力，不可轻攻。毅斋，你意如何？”
刘锦棠说道：“叔父大人容禀。暗探已打探明白，白贼已把部众一分为四，分路退往金积堡，想赖马化龙之力，长久与我抗衡。愚侄以为，金积堡一带地方，地形险恶，若任由白贼窜去，恐成不了之局，莫不如在白贼退往途中半路击之。暗探又报称，白贼此次退往金积堡，并非真心想和马化龙会合，他不过是想通过金积堡而到达肃州（今甘肃酒泉），由肃州而出关外。”
刘松山大惊道：“毅斋，你是说，白贼是想出关，去与那个洋犊子阿古柏会合？”
刘锦棠答道：“暗探称，白贼正是此意。”
刘松山低头想了想，道：“毅斋，你我两路人马，不过两万人，白贼却有十余万众。据说，白贼光火枪营就达二十营，骑勇也有三十营，还有两个炮营，若攻之不利，必被其所害。我以为，还是等刘抚台、老爵帅等各营到后，再计议进击为上策。毅斋，杀敌最忌心急，心急必露破绽。这是曾相国常讲的话，你可细细揣摩。”
刘锦棠答道：“叔父大人所言极是，愚侄可只对白贼监视，若有军情，随时禀报吧。”
刘松山道：“毅斋呀，董福祥所降人众，尚未办理遣散事宜，都是因为没有粮饷啊。董部不办理明白，任由这些人反投到白贼那里去，其祸大矣！”
刘锦棠点头称是。刘锦棠离去的当夜，刘松山所部两营兵勇发动哗变，因刘松山发现及时，出兵过快，没有造成损失。两名营官被刘松山就地处斩，兵变平息。
左宗棠此时正在同着刘典、袁保恒等人，筹办在西安设立西安制造局的事。
对西安设立制造局的事，宁夏将军署陕甘总督穆图善却持有异议。为了阻挠这件事，他两次上奏朝廷，认为左宗棠在西安设立制造局，是好名之举，除了徒费饷银，不会对西征有丝毫帮助。为此，朝廷曾两次给曾国藩、李鸿章下旨，征询对此事的态度。
曾、李二人却都持赞成态度，认为设立西安制造局，是巩固西征的根本举措，有百益而无一害。朝廷于是诏准。西安制造局总算赶在同治八年（公元1869年）的新年到来之前宣告成立。
左宗棠委西征粮台督办袁保恒兼西安制造局督办。为防大军进甘后布政使林寿图掣肘，左宗棠又奏请准袁保恒专折奏事。
林寿图万没料到自己身为一省藩台，在西征粮台与西安制造局成立之际，竟然被左宗棠排除于事务之外，一气之下，横下一条心来，要同左宗棠闹上一闹，把长久憋在心里的那几口恶气出一出，也让左宗棠见识一下他的手段。
这一天，他借着给西安将军库克吉泰送礼的由头，到将军府来拜望库克吉泰。
库克吉泰与宁夏将军穆图善是儿女亲家，林寿图素来都对库克吉泰高看一眼，何况将军并不受地方督抚节制，直接归朝廷调遣，这就更让林寿图把库克吉泰当成了一座靠山。
库克吉泰对林寿图的到来是极其欢迎的，林寿图奉上年敬之后，库克吉泰更是热情异常。库克吉泰虽是位将军，但在贫困的陕西地面，能给他送上份像样年敬的人并不多，尤其是左宗棠到西安以后，除了布政使林寿图以及自己的属官逢年过节还记着他，给他送礼的人几乎就更少了。
刘典是署抚，又是京卿衔，他现在在西安，除左宗棠外，几乎不买任何人的账，库克吉泰休想从刘典手里捞到任何好处。但林寿图有林寿图自己的算盘。
一杯热奶未喝完，林寿图便神秘地说道：“库大帅，您老没有发现吗？这陕西自从左季高来了之后，不仅司里这藩司成了皇上家的摆设，连您老这堂堂的西安大将军，也快成了摆设了。这左季高想干什么呀？”
库克吉泰不知林寿图这话里藏着的意思，反倒哈哈笑道：“我大清立国至今，从来都是讲究‘能者多劳’这四个字。左季高能耐大，又赐封了伯爵，他自己原本就是该多干些事情，才不负上头对他的期望。本官老了，在西安多年，不仅腰眼子常酸，老寒腿也是每到这个季节便发作。本官是不想再做什么功劳了。有功劳，本官都留给他左季高去干。无论怎么讲，本官辛苦了这么多年，该享几天清福了！”
林寿图一见库克吉泰说出这等话来，便知这位西安将军，是不想再有所作为了，于是也就住了口。
林寿图回到府邸后，又整整思虑了两天，便忽然向刘典写了篇告假的快函，提出要回原籍去省墓。刘典当时正在和刘松山会在一处，他原本已和刘松山、刘锦棠等前敌将领约好，想在大年底下再回西安去过年，今见林寿图忽然要告假，便只得把大营的事料理了一下，同刘松山、刘锦棠以及各路人马中总兵衔以上的武职大员，提前赶回西安。衙门每逢年底都比较忙碌，藩、臬二司更忙，衙门有许多事情要赶在大年之前办理完结。林寿图在这个时候要告假回籍省墓，这的确是在给刘典这个署抚出难题。
刘典回到巡抚衙门的当日，便急传林寿图来见，送信的亲兵却回称：藩台大人正在府里打点行装，不得空闲。林寿图等于是在同刘典叫板。
刘典无奈，只好来见左宗棠。
左宗棠却笑道：“我大清素来以孝治国，林藩司此时回籍省墓不仅该准假，还应当奏请上头表彰于他。克庵哪，给朝廷的这个折子本部堂来写，你会衔。”
刘典笑笑没言语，他是被林寿图、左宗棠二人给弄糊涂了。
左宗棠当日交代刘典，暂委袁保恒到布政使司衙门，去接办林寿图未竟事务，然后便把自己关在书房里，开始给朝廷拟折子。
左宗棠先说林寿图肯于任事，是陕甘两省不可多见的能员。又说刘典统兵离开西安期间，巡抚衙门一应事务，俱由该员代为料理等，然后才话锋一转写道：“奈该员体弱多病，不堪繁剧，每每在人前陈述诸多苦处，往往涕泪俱下，又多次陈情开缺回籍休养之因由，实属迫不得已。”折子最后才道出真意：“恳请朝廷体恤该员苦处，准予回籍休养有年，待身体复原后，再图报答。臣查二品顶戴、西征粮台督办、西安制造局总办袁保恒，于钱粮事务比较熟悉，可胜任陕西藩司一职。”
大年一过，左宗棠就要同刘典等人统兵离开西安，他只是不放心林寿图这个人。为免除后顾之忧，也为事权归一，他决定让林寿图回籍休养，以便袁保恒能放开手脚做事。左宗棠这么做，不仅林寿图没有想到，连西安将军库克吉泰和宁夏将军署陕甘总督穆图善也没有想到。
新年尚未过去，已回原籍的林寿图，便收到陕西巡抚衙门转来的圣谕：朝廷为体恤臣子，准予林寿图以原品休致。林寿图未及把圣谕读完，便觉眼前一黑，一头便栽倒在地。
正想在官场有番作为的林寿图，就这样糊里糊涂地被朝廷准予休致了。清朝官员所谓的休致，按现在的话讲，就是退休。本不想退休的人你让他退休了，换谁都要一头栽倒。
